我院科研人员在脂质代谢相关多组学生物信息数据资源平台研发方面取得新进展，相关成果近日以“DBLiPro: A Database for Lipids and Proteins in Human Lipid Metabolism”为题，在《表型组学》（Phenomics）杂志在线发表，我院感染与免疫研究所组学研究与应用课题组李园园研究员、戴文韬副研究员和北京携云启源黄泽炽总监为共同通讯作者。
       脂质在细胞功能中发挥重要作用，同心血管疾病(CVD)、阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease)、2型糖尿病、癌症和自身免疫性疾病等密切相关。伴随分析化学技术的进步，脂质组学近年来发展迅速，对脂类代谢相关数据分析资源提出了更高要求，特别是亟需一套综合系统的脂质代谢相关蛋白知识库，并据此形成方便实用的以脂质代谢和功能研究为中心的多组学整合分析工具。针对上述需求，我院组织合作团队开发了DBLiPro，以帮助生物、医学、化学和材料科学领域的研究人员，轻松高效地进行聚焦于人类脂代谢相关脂质和蛋白质功能的多组学整合研究。
       依托于在“转录-代谢”多组学整合分析领域的积累，该课题组参与了空间多组学新技术揭示胃癌相关细胞特异的代谢重编程与互作的研究工作；同中国医学科学院药物研究所、齐鲁工业大学（山东省科学院）、北京大学肿瘤医院等单位密切合作，整合空间代谢组学（Spatially resolved metabolomics）、空间脂质组学（Spatially resolved lipidomics）和空间转录组（Spatially resolved transcriptomics）技术，在同一肿瘤组织样本的相邻切片上，实现了肿瘤组织微区中代谢组、脂质组和转录组数据的原位精准联合分析；并鉴别细胞种类，构建代谢物/脂质和上游调控基因的关联网络，实现了肿瘤组织微环境中肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞等代谢调控及交互作用的原位表征；为肿瘤代谢的深入研究提供了创新的有效方法、工具和新视角。合作团队进一步对临床术后胃腺癌组织进行了空间多组学分析，发现一系列胃癌发生发展和免疫逃逸相关的细胞特异的代谢重编程关键分子以及一个富含免疫细胞存在代谢重编程的“肿瘤边界区域，tumor interface region”，有助于深入理解胃癌分子机制，指导精准治疗。该研究成果以“Spatially resolved multi-omics highlights cell-specific metabolic remodeling and interactions in gastric cancer”为题，于近期在Nature Communications（《自然•通讯》）杂志上在线发表。齐鲁工业大学（山东省科学院）孙成龙研究员、北京大学肿瘤医院王安强副教授、药物所硕士生周晏合为本文共同第一作者。中国医学科学院药物所贺玖明研究员、北京大学肿瘤医院季加孚教授、步召德教授和上海市生物医药技术研究院戴文韬副研究员为本文的共同通讯作者。
       我院感染与免疫研究所组学研究与应用课题组的上述研究，受到国家自然科学基金、上海科学院关键共性技术攻关计划、上海生研院优秀青年科技人才培育专项等项目的资助。